本学科创建于1980年，融入上海交通大学以后，蔬菜学学科建设依托学校的理工优势，以生物技术、信息技术和工程技术为支撑，形成了设施园艺工程与技术、蔬菜遗传育种与生物技术和蔬菜生理与生态安全三个特色学科发展方向：

　　设施园艺工程与技术　形成了温室智能控制技术、温室作物生长模型模拟、温室环境调控与决策支持系统、温室作物生产精准作业管理等学科交叉融合的研究特色。以蔬菜等园艺作物为对象，与机械制造及自动化国家重点学科、模式识别及智能系统国家重点学科联合，形成了学科交叉的研究团队。在国家“863”、农业科技成果转化基金、上海市科技兴农重点攻关项目、上海市优秀学科带头人等专项资金的资助下，构建了基于甜瓜生长模拟模型的管理系统软件、出口蔬菜HACCP管理软件、JDS穴盘苗管理软件等，已被星辉蔬菜、银龙蔬菜加工厂应用。2004年以来获上海市科技进步二、三等奖3项，获国家发明专利和软件著作权6项，发表SCI、EI论文10余篇。

　　蔬菜遗传育种与生物技术　采用基因工程和分子标记辅助育种等技术对番茄和黄瓜种质进行遗传改良，遗传图谱构建，形成了功能基因克隆、抗蚜虫、白粉病、耐盐碱等转基因和分子标记辅助育种等研究特色。2004年以来获国家“863”和上海市重点项目资助，获上海市科技进步二等奖1项，三等奖1项。国家发明专利授权7项，国家品种保护权黄瓜2个；通过上海市品种审定黄瓜6个，萝卜2个，番茄2个，菜用大豆、扁豆、甜豌豆等豆类品种5个，在全国10多个省市推广，面积累积达30万亩次。发表论文50多篇，其中SCI论文28篇。

　　蔬菜生理与生态安全　以提高蔬菜产品的产量、品质和安全性为目标，形成了以蔬菜发育生理、蔬菜栽培生态与环境修复、蔬菜生产过程控制及其技术等研究特色。2004年以来获得国家863和上海市地方重大项目资助10项，在蔬菜病虫害生态化防治和抗性生理达到国内外先进水平，其中多功能木霉菌剂创制和生态化防治蔬菜土传病害分子机理的研究在国内形成了特色。获省部级科技进步二等奖1项，获国家发明专利3项，并在上海等十余个省市推广；发表SCI论文6篇，完成各类政府决策咨询报告3份。

　　本学科学术骨干年富力强，现有教授12名（博导11名），副教授5名，讲师5名；平均年龄41岁，学源关系广泛（日本、英国、美国、荷兰留学回国7名，有博士学位16名）。

　　蔬菜学学科团队在温室蔬菜标准化与数字化管理、蔬菜生理与环境生物学、蔬菜分子标记辅助育种、抗病虫耐盐碱等功能基因克隆与转基因研究等领域创新成果显著。

　　蔬菜学学科2000年开始，在“生物医学工程”、“机械工程”一级学科下自设二级学科博士点“设施园艺工程”，已培养毕业硕士生34名，博士研究生8名，出站博士后3名。“蔬菜学”博士点在读博士生36名，硕士生35名。

　　本学科“985”一期重点建设经费1460万元，添置了植物分子生物学、现代化温室、人工气候室、温室环境数据采集装置等设施设备。“复旦－交大－诺丁汉植物生物技术研究中心”提供了国际合作交流交流平台，与“国家农业信息化技术研究中心”联合成立的“数字农业联合实验室”通过项目合作、研究生联合培养等方式打造农工结合、学科交叉的研究平台。